Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms