Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbe1Q9D6Y9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms