Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam227bQ9D518 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms