Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Taf1dQ9D4V4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Taf1dQ9D4V4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Taf1dQ9D4V4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Taf1dQ9D4V4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Taf1dQ9D4V4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Taf1dQ9D4V4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1dQ9D4V4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1dQ9D4V4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1dQ9D4V4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1dQ9D4V4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms