Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms