Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag1Q9D3E6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms