Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snapc3Q9D2C9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snapc3Q9D2C9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snapc3Q9D2C9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snapc3Q9D2C9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snapc3Q9D2C9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snapc3Q9D2C9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snapc3Q9D2C9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms