Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms