Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms