Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms