Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Wdr55Q9CX97 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr55Q9CX97 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms