Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sycp2Q9CUU3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms