Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930524J08RikQ9CUJ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms