Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms