Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Riok2Q9CQS5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riok2Q9CQS5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms