Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms