Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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