Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NepnQ9CQ76 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NepnQ9CQ76 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NepnQ9CQ76 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NepnQ9CQ76 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NepnQ9CQ76 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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NepnQ9CQ76 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms