Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms