Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms