Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms