Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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