Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms