Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms