Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg3Q99P81 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg3Q99P81 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms