Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms