Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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