Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms