Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms