Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms