Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms