Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtcbQ99LF4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms