Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf19Q99KP6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms