Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms