Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms