Protein–RNA interactions for Protein: Q920V1

B3galnt1, UDP-GalNAc:beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3galnt1Q920V1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
B3galnt1Q920V1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B3galnt1Q920V1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B3galnt1Q920V1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B3galnt1Q920V1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B3galnt1Q920V1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B3galnt1Q920V1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms