Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usb1Q91W78 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms