Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Klc3Q91W40 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms