Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp3Q91W36 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms