Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms