Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms