Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh10Q8VCH7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rdh10Q8VCH7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh10Q8VCH7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh10Q8VCH7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rdh10Q8VCH7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rdh10Q8VCH7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rdh10Q8VCH7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh10Q8VCH7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh10Q8VCH7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rdh10Q8VCH7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms