Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Top1mtQ8R4U6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Top1mtQ8R4U6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Top1mtQ8R4U6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Top1mtQ8R4U6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Top1mtQ8R4U6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Top1mtQ8R4U6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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Top1mtQ8R4U6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1mtQ8R4U6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Top1mtQ8R4U6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top1mtQ8R4U6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Top1mtQ8R4U6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Top1mtQ8R4U6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top1mtQ8R4U6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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Top1mtQ8R4U6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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