Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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FgbQ8K0E8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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FgbQ8K0E8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms