Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms