Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf628Q8CJ78 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms