Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms