Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc63Q8CDV6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms