Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc9Q8CDN9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc9Q8CDN9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms