Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl3Q8CD19 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms